Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms