Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms