Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FOXD4L6Q3SYB3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4L6Q3SYB3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms