Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00303Q3SY05 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms