Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP41Q3LFD5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms