Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC96Q2M329 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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