Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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