Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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RTN1Q16799 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTN1Q16799 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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