Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIST3H3Q16695 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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