Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms