Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms