Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK7Q16549 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms