Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CDSNQ15517 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CDSNQ15517 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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CDSNQ15517 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDSNQ15517 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CDSNQ15517 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CDSNQ15517 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CDSNQ15517 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CDSNQ15517 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CDSNQ15517 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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CDSNQ15517 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDSNQ15517 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDSNQ15517 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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