Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SEC23BQ15437 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SEC23BQ15437 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SEC23BQ15437 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SEC23BQ15437 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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