Protein–RNA interactions for Protein: Q15173

PPP2R5B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R5BQ15173 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPP2R5BQ15173 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PPP2R5BQ15173 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms