Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMD6Q15008 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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