Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms