Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSME4Q14997 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSME4Q14997 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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