Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC10A1Q14973 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms