Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLINT1Q14677 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms