Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GTF2H2Q13888 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GTF2H2Q13888 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GTF2H2Q13888 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GTF2H2Q13888 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GTF2H2Q13888 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GTF2H2Q13888 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GTF2H2Q13888 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GTF2H2Q13888 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2H2Q13888 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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