Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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