Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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