Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR3Q13615 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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