Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF5Q13568 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms