Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BFSP2Q13515 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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