Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPA4Q13156 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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