Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPS1Q13098 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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