Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRAF1Q13077 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRAF1Q13077 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRAF1Q13077 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRAF1Q13077 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TRAF1Q13077 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRAF1Q13077 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF1Q13077 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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