Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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TRAF2Q12933 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TRAF2Q12933 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TRAF2Q12933 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TRAF2Q12933 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF2Q12933 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF2Q12933 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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