Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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