Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMAN2Q12907 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms