Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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