Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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