Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms