Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms