Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RASGEF1BQ0VAM2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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