Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms