Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms