Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNB2Q08289 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNB2Q08289 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms