Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
COL16A1Q07092 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL16A1Q07092 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms