Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FMODQ06828 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FMODQ06828 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FMODQ06828 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms