Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD51Q06609 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms