Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms