Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RELAQ04206 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RELAQ04206 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RELAQ04206 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELAQ04206 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELAQ04206 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELAQ04206 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELAQ04206 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELAQ04206 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELAQ04206 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RELAQ04206 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELAQ04206 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELAQ04206 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELAQ04206 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELAQ04206 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELAQ04206 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELAQ04206 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELAQ04206 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RELAQ04206 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms