Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LINC01697-206ENST00000616647 544 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CBR3-AS1-204ENST00000453159 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TPT1P4-201ENST00000403538 519 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL353770.4-202ENST00000621296 1126 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 BX005040.1-201ENST00000622281 1126 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TM2D3-202ENST00000347970 1329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms