Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSC2Q02487 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms