Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF17Q02223 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms