Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms