Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms